Az MNL Szabolcs-Szatmár-Bereg Megyei Levéltára iratanyagában összesen 122 fondban található jelentős adattartalom a protestáns egyházak történetére vagy a protestáns intézményekre, személyekre vonatkozóan.
A számos értékes irategyüttes között a korai időkre vonatkozóan egyik kiemelkedő Szabolcs Vármegye Nemesi Közgyűlésének anyaga, (jegyzőkönyvek és hozzájuk kapcsolódó iratok együttese). A protestáns felekezetekhez kapcsolódnak a templomépítések, lelkészi javadalmak, iskolák ügyei. A megyében több összeírás is készült, amely adatokat szolgáltat a megye falvaiban működő iskolamesterekről, a lakosság vallási felkezetekhez tartozásáról. A 18. századi anyagból kitűnik, hogy a Helytartótanács felügyelete alatt nagyon bürokratikusan és lassan folyhattak csak a protestánsok templomépítési és a javítási munkák. Kérelmek, vizsgálatok, tanúkihallgatások, engedélyek és tilalmak jelzik az ellenreformációs törekvések térnyerését. A 19-20. századianyagok közül Nyíregyháza (rendezett tanácsú) város polgármesteri hivatala irataiban nemcsak az evangélikus és a református egyház ügyei, de néhány alkalommal a baptista és a methodista felekezetek is feltűntek.
A mellékelt táblázat tartalmazza a fondok, állagok jelzetét, megnevezését, évkörét, terjedelmét, a benne található, a reformációra, protestantizmusra vonatkozó iratanyag leírását, jellemzését, valamint a kutatást megkönnyítő segédletek jelzését. A feltárt iratok évköre 1550-től a 20. század végéig terjed. Az általános információk mellett csaknem minden fondról tartalmaz az áttekintés részletes kutatási tudnivalókat és érdekességeket, amelyek alapján könnyű a tájékozódás.